第214章 双眼（2/2）
给佐井下达了暗杀佐助的任务，但后来由于种种原因而导致暗杀佐助的任务失败。团藏得知此事后，说出“感情带来仇恨，仇恨导致战争”的话语。
在“晓”的首领佩恩为了捕获九尾而袭击木叶时，团藏为了趁机夺取火影之位，而杀了正要前往妙木山通知战事的联络蛙孝介，试图隐瞒战事来牵制住鸣人的行动范围；并召集过去的“根”成员，下令让木叶陷于佩恩入侵的苦战中而不伸出援手。纲手在佩恩入侵一战后因虚耗过度陷入昏迷中，团藏便趁机在火之国会议中直指纲手已不能履行职责，应委任新一任火影，并道出过往火影治理上的不当，唯有自己才是最理想的人选，最终被大名指定为“第六代火影”。
团藏在成为火影后立刻将宇智波佐助定为叛忍并下达追杀令，亦允许雷之国忍者前往追杀。
在五影会谈上，他利用先前夺取的止水的写轮眼控制了铁之国大将三船，企图夺取忍者联军控制权，但被拥有白眼的雾忍青所识破。于是团藏向其他四影说出自己有意效仿初代火影统一各个族落那样来统一整个忍者世界，并且会不惜一切代价来完成这个目的，这样忍者世界才能步入真正“和平”的道路，但他的想法遭到其他四影的反对。
此时，佐助也因为宇智波带土的讲述而知道关于鼬的真相，打算杀死木叶高层来告慰亡兄，并乱入五影会谈的会场企图刺杀团藏。佐助的行动遭到其他各影以及铁之国武士的阻止，团藏在混乱之中逃脱。这一举动被雷影认为让木叶失去其他四大忍村的全部信任。
佐助在会场中被宇智波带土所救，之后和带土一同追上逃离会场的团藏。团藏利用先前获得的宇智波族人写轮眼施展了禁术“伊邪那岐”，让佐助发动的攻击变得无效。但在最后佐助利用写轮眼的幻术破解了团藏的伊邪那岐，团藏因此身受重伤，为了保存实力而挟持了在场的香燐打算逃跑，但一心复仇的佐助完全不顾香燐的安危，将团藏和香燐一同贯穿。团藏在临死前为了死守止水之眼，发动了里四象封印术打算与佐助、带土同归于尽，但最终失败。团藏在临死前感叹到自己到最后都没能成为火影，自己无论如何都无法追上日斩。并评价日斩和自己道“你是沐浴阳光的木叶，我是深埋地下的根。”
志村团藏，年轻时担任过第二代火影的精锐护卫部队中的成员，是和猿飞日斩争夺过火影之位的男人。在争夺继承者失败后，他成为了火影直属队伍“暗部”中“根”的创建者与领导人。有着只顺从自己意志的忍者队伍，掌握着木叶的“黑暗”。他是下令对宇智波一族实施灭族政策的木叶高层之一。
团藏有着一头棕色的头发，留着整齐的平鬓，一只细长的眼睛，目光狡黠而深邃。头部和右眼用绷带裹着，将止水的写轮眼隐藏其中。下巴位置有一个叉形的疤痕。他的脸色略显阴沉，皱纹深刻，给人一种阴险而老谋深算的感觉。他的身材虽然瘦削，但肌肉结实。身穿黑灰色和服，右手臂上移植了柱间细胞和十一只写轮眼，并用封印器皿将写轮眼牢牢封印，只有使用时才会解开，平时一直隐藏在衣袖里。
不过这个时期的团藏还没有经历那些。
极度多疑、谨慎、阴险、手段强硬，不相信他人，不能容忍一丁点可能会出现的疏漏，一定按照自己的想法走才肯放心。他常把“忍者要自我牺牲”挂在嘴边，但真正轮到他的时候，自己却做不到。
这也是他当初落后猿飞日斩，没有成为火影的原因。
原剧情中，在五影会谈推选忍者联军统领时，即使三船本就有意推荐他，但他仍要以别天神控制三船，支配其行动。为了防止泄密，对所有部下施加了咒印术。
团藏的木遁秘术源于移植初代火影柱间的细胞。因为十一只“写轮眼”具有很大的精神能量，所以需要柱间的细胞来增加“肉体能量”与之平衡，但由于不是初代的完整复制品，其木遁之术只能通过右臂才能施展出来。在战斗中，团藏自身查克拉减弱无法支配柱间的细胞时，会被其吞噬。
写轮眼是宇智波一族特有的血继限界，具有观察眼、复制眼、催眠眼等强大的能力。拥有者具有超乎常人的洞察力，能观察查克拉流动，可以施加和识破幻术，复制体术和非血继限界忍术。团藏在消灭宇智波一族的行动中，收集了宇智波一族的写轮眼和抢夺了止水的右眼，并且都移植到了自己身上，使自己拥有了宇智波一族的瞳术。
当然现在的团藏也还不具备这些，否则的话上一次长门就无法从团藏手中逃脱。
“先将那双眼睛给我。”
在团藏的示意下，身后的两名根部忍者来到了长门的身前，从已经失去双眼的长门手中拿过了两颗淡紫色的轮回眼，随后转身交到了团藏的手上。
在这个过程中，长门并没有做出任何反抗，在他决定好贡献出自己的双眼那一刻，就将自己的生死置之度外了。只要能够保证父母安然无恙，就没有什么是他不能牺牲的。
在从自己的手下那里接过了两颗轮回眼之后，团藏拿出了事先准备好的两只玻璃试管，将两颗轮回眼分别装了进去。这是团藏为了此次行动，早就准备好的。
“终于，终于得到了这双仙人之眼，它们是我的了。”
团藏小心翼翼的将装有轮回眼的玻璃容器给收好，那可是他成为火影的希望。
“现在可以将我的父母都放了吧？”
半跪在地上的长门由小晴搀扶着，失去了眼球的眼眶紧闭着，仅凭感觉朝着团藏所在的方向询问道。